Fisabio i la Universitat de València participen en un estudi internacional que avalua l’impacte del diagnòstic metagenòmic en les infeccions greus

La Fundació Fisabio i la Universitat de València han
participat en un estudi internacional que analitza l’impacte de la
metagenòmica clínica en el diagnòstic d’infeccions greus i la seva repercussió
atenció als pacients.
El treball, publicat a la revista The Lancet Infectious Diseases, revisa de
forma sistemàtica més d’un centenar d’investigacions per avaluar la
utilitat d’aquesta tècnica a la pràctica clínica. Els resultats mostren que la
metagenòmica clínica està oferint bons resultats en el diagnòstic de
algunes infeccions respiratòries com pneumònies greus o atípiques a
pacients ingressats a UCI. A més, està demostrant ser útil en casos
complexos de meningitis o encefalitis quan les proves microbiològiques
tradicionals no aconsegueixen detectar lorigen de la infecció.
La metagenòmica clínica també ha resultat beneficiosa per al diagnòstic
de precisió en pacients oncològics, persones trasplantades o amb sistemes
immunitaris molt debilitats, en els quals la detecció ràpida de qualsevol
patogen és crítica per a la seva supervivència.
Finalment, segons l’estudi, l’ús més freqüent d’aquesta prova és el cribratge
ràpid d’infeccions difícils de diagnosticar i de patògens resistents a
fàrmacs. Això permet al personal mèdic tant prendre decisions més ràpides
sobre els tractaments que rebien els pacients, com ajustar, canviar o
retirar antibiòtics.

A més, la revisió posa de manifest que aquesta tècnica facilita la detecció
precoç d’infeccions complexes i de microorganismes resistents als
antibiòtics, cosa que permet ajustar abans els tractaments i afavorir-ne un ús
més racional daquests medicaments.
Una tècnica amb creixent aplicació clínica
La metagenòmica clínica permet analitzar el material genètic present en una
mostra biològica i identificar virus, bacteris, fongs i altres
microorganismes sense necessitat de saber per endavant què s’està buscant.
Aquesta capacitat la converteix en una eina especialment útil per al
diagnòstic d’infeccions complexes o d’origen desconegut.
L’evidència científica acumulada dóna suport al rendiment tècnic, la utilitat
manifesta en diversos casos específics i el seu potencial com a prova
transformadora en el diagnòstic de malalties infeccioses. Xavier López
Labrador, coautor de l’article, Cap del grup Virologia i Salut Pública del
Àrea de Genòmica i Salut de Fisabio, i professor titular a la Secció de
Microbiologia de la Facultat de Medicina de la Universitat de València, explica
que la metagenòmica clínica mitjançant seqüenciació massiva “representa un
enfocament diagnòstic transformador i la seva incorporació a la pràctica clínica està
en plena expansió".
Així mateix, assenyala que aquest treball «ofereix una visió de l’ús real d’aquesta
tècnica en pacients hospitalitzats. L’evidència acumulada recolza la seva
rendiment tècnic, demostra la seva utilitat en diferents escenaris clínics i
confirma el seu potencial per transformar el diagnòstic de les malalties
infeccioses".
López Labrador coordina, des de la Societat Europea de Virologia Clínica
(ESCV), el grup de treball europeu sobre seqüenciació massiva per al
diagnòstic clínic